Comparative proteomic analysis of sulfur-oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans CCM 4253 cultures having lost the ability to couple anaerobic elemental sulfur oxidation with ferric iron reduction
| Název česky | Srovnávací proteomická analýza sirných kultur Acidithiobacillus ferrooxidans CCM 4253, které ztratily schopnost propojit anaerobní oxidaci elementární síry s redukcí železa(III) |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2016 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Research in Microbiology |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Doi | http://dx.doi.org/10.1016/j.resmic.2016.06.009 |
| Obor | Biochemie |
| Klíčová slova | Acidithiobacillus ferrooxidans; Anaerobic respiratory pathway; Sulfur metabolism; Ferric iron reduction; Proteomics |
| Popis | Ve velmi kyselém prostředí mohou být Fe(III) ionty termodynamicky výhodným akceptorem elektronů během oxidace elementární síry za anaerobních podmínek u některých druhů Acidithiobacillus. Kvantitativní 2D-PAGE proteomická analýza suspenze klidových buněk sirné subkultury Acidithiobacillus ferrooxidans CCM 4253, která ztratila svou schopnost redukovat Fe(III), odhalila 147 proteinových spotů, jejichž intenzita byla snížena a 111 spotů, jejichž intenzita byla zvýšena vzhledem ke klidové buněčné suspenzi předešlé sirné kultury, která ještě byla schopna redukovat Fe(III). Analýza výrazně snížených spotů pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie identifikovala několik fyziologicky důležitých proteinů, které zjevně hrají roli při oxidaci železa, jako je membránový cytochrom Cyc2 anebo rusticyanin. Mezi dalšími proteiny, jejichž exprese byla silně potlačena, byly proteiny spjaty s metabolismem síry včetně heterodisulfidreduktasy, thiosíran:chinonoxidoreduktasy a sulfid:chinonreduktasy. Následná analýza na úrovni RNA odhalila deregulaci i některých dalších respiračních genů. Části systému oxidace železa tak zřejmě hrají ústřední roli i během anaerobní oxidace síry, a to při redukci železa, u studovaného mikrobiálního kmene. |
| Související projekty: |