Application of Next-Generation Sequencing in Plant Breeding
| Název česky | Aplikace sekvenování nové generace ve šlechtění rostlin |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2017 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Czech Journal of Genetics and Plant Breeding |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Doi | http://dx.doi.org/10.17221/192/2016-CJGPB |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | gene expression; marker-assisted selection; molecular marker; RNA-sequencing; SNP |
| Popis | Technologie sekvenování nové generace (NGS) znamenaly v posledním desetiletí průlom v našich znalostech o genomech významných plodin a způsobech regulace jejich genů. V současné době se navíc jejich využití rozšiřuje na metagenomický a agrigenomický výzkum, s potenciálem využití získaních informací ve šlechtění. Díky výkonným sekvenačním technikám je možné jak získat informace o regulaci konkrétního genu, tak obsáhnout celý rostlinný genom prostřednictvím sekvenování transkriptomu a navazujících expresních analýz a identifikovat tak geny podílející se na obraně rostliny proti patogenům nebo umožňující toleranci vůči abiotickému stresu. NGS dále usnadnily vývoj metod umožňujících genotypování velkého množství vzorků a hledání polymorfimsů na úrovni jednotlivých nukleotidů. Genotypování sekvenováním a celogenomové sekvenování vedly k vývoji molekulárních markerů vhodných pro fylogenetické studie mezi šlechtěným materiálem, vytváření podrobných genetických map cílových genů and celogenomových asociačních studií. Genotypování rostlin usnadňuje ve šlechtění výběr jedinců odolných vůči abiotickému stresu a patogenům způsobíjících významné škody v zemědělství. |
| Související projekty: |