Genetické určení barvy očí u jedinců ze Znojma-Hradiště

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

LYSÁKOVÁ Petra BRZOBOHATÁ Kristýna DROZDOVÁ Eva ALLEN Marie BUS Magdalena

Rok publikování 2018
Druh Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Popis Znojmo-Hradiště je velkomoravská lokalita nedaleko města Znojma. Od objevení v roce 2007 do roku 2015, kdy archeologický výzkum probíhal, bylo odkryto více než 500 objektů, z nichž většinu představovaly hrobové jámy. Výzkum této unikátní lokality je multidisciplinární a probíhá za využití celé řady vědních disciplín včetně antropologie, genetiky, ale také rekonstrukce vzhledu. Určení viditelných fenotypových charakteristik z DNA je součástí snah o rekonstrukci podoby osoby neznámého vzhledu. V souboru koster ze Znojma-Hradiště, který byl analyzován, byla u čtyř jedinců rekonstruována podoba. Soubor byl dále doplněn jedinci s kompletní obličejovou částí lebky, kde bude možná rekonstrukce v budoucnu. Lidský genom obsahuje 6 genů, které mají vliv na determinaci barvy očí, přičemž nejvýznamnější vliv má polymorfismus rs12913832 genu HERC2. Pro detekci polymorfismu rs12913832 byly zvoleny dvě metody. První využívala predesignovanou sondu TaqMan®. Bylo analyzováno 20 vzorků DNA jedinců ze Znojma-Hradiště, u 19 se podařilo marker detekovat a odhadnout tak fenotyp. U 15 jedinců byl genotyp určen jako sestava T/C, 4 jedinci byli determinováni jako homozygotní s alelami CC v detekovaném lokusu. Druhá metoda detekce byla založena na Irisplex systému. Primery z tohoto systému byly využity pro konvenční PCR a následné Sangerovo sekvenování. Celkem bylo analyzováno 12 aDNA vzorků z pohřebiště Znojmo-Hradiště, z nichž se u 3 povedlo určit genotyp všech šesti zařazených polymorfismů. U 5 vzorků, u nichž byl detekován genotyp pro polymorfismus rs12913832 genu HERC2, se konečný výsledek sekvenování shodoval s výsledkem analýzy pomocí sondy TaqMan®.

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.