Genetické určení barvy očí u jedinců ze Znojma-Hradiště
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2018 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Znojmo-Hradiště je velkomoravská lokalita nedaleko města Znojma. Od objevení v roce 2007 do roku 2015, kdy archeologický výzkum probíhal, bylo odkryto více než 500 objektů, z nichž většinu představovaly hrobové jámy. Výzkum této unikátní lokality je multidisciplinární a probíhá za využití celé řady vědních disciplín včetně antropologie, genetiky, ale také rekonstrukce vzhledu. Určení viditelných fenotypových charakteristik z DNA je součástí snah o rekonstrukci podoby osoby neznámého vzhledu. V souboru koster ze Znojma-Hradiště, který byl analyzován, byla u čtyř jedinců rekonstruována podoba. Soubor byl dále doplněn jedinci s kompletní obličejovou částí lebky, kde bude možná rekonstrukce v budoucnu. Lidský genom obsahuje 6 genů, které mají vliv na determinaci barvy očí, přičemž nejvýznamnější vliv má polymorfismus rs12913832 genu HERC2. Pro detekci polymorfismu rs12913832 byly zvoleny dvě metody. První využívala predesignovanou sondu TaqMan®. Bylo analyzováno 20 vzorků DNA jedinců ze Znojma-Hradiště, u 19 se podařilo marker detekovat a odhadnout tak fenotyp. U 15 jedinců byl genotyp určen jako sestava T/C, 4 jedinci byli determinováni jako homozygotní s alelami CC v detekovaném lokusu. Druhá metoda detekce byla založena na Irisplex systému. Primery z tohoto systému byly využity pro konvenční PCR a následné Sangerovo sekvenování. Celkem bylo analyzováno 12 aDNA vzorků z pohřebiště Znojmo-Hradiště, z nichž se u 3 povedlo určit genotyp všech šesti zařazených polymorfismů. U 5 vzorků, u nichž byl detekován genotyp pro polymorfismus rs12913832 genu HERC2, se konečný výsledek sekvenování shodoval s výsledkem analýzy pomocí sondy TaqMan®. |