In Cell NMR Spectroscopy: Investigation of G-Quadruplex Structures Inside Living Xenopus laevis Oocytes

Logo poskytovatele
Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

KRAFČÍKOVÁ Michaela HANSEL-HERTSCH R. TRANTÍREK Lukáš TRANTÍRKOVÁ Silvie

Rok publikování 2019
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj G-QUADRUPLEX NUCLEIC ACIDS: METHODS AND PROTOCOLS
Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Citace
www https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-4939-9666-7_25
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9666-7_25
Klíčová slova In-cell NMR; Xenopus laevis oocyte; DNA; RNA; G-quadruplex
Popis G-quadruplexes are inherently polymorphic nucleic acid structures. Their folding topology depends on the nucleic acid primary sequence and on physical-chemical environmental factors. Hence, it remains unclear if a G-quadruplex topology determined in the test tube (in vitro) will also form in vivo. Characterization of G-quadruplexes in their native environment has been proposed as an efficient strategy to tackle this issue. So far, characterization of G-quadruplex structures in living cells has relied exclusively on the use of Xenopus laevis oocytes as a eukaryotic cell model system. Here, we describe the protocol for the preparation of X. laevis oocytes for studies of G-quadruplexes as well as other nucleic acids motifs under native conditions using in-cell NMR spectroscopy.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.