CryoEM ensemble reveals the mechanism of 1 ribosomal frame shifting
| Název česky | Soubor kryoEM struktur odhaluje mechanismus posunu 1 ribozomálního cteciho rámce |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2022 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Aby ribozom přesně syntetizoval protein, udržuje čtecí rámec mRNA dekódováním a translokací jednoho kodonu po druhém. Změna čtecího rámce mRNA během translace, nazývaná posun rámce, poskytuje strategii pro rozšíření kódovacího repertoáru buněk a virů. Translační ribozom se přepne do alternativního čtecího rámce, buď v předném nebo reverzním směru, tj. přeskočení nebo opětovné načtení jednoho nebo více nukleotidů mRNA, v daném pořadí. Například posun 1 rámce (1FS) řídí expresi esenciálního faktoru uvolňování 2 v bakteriích a vede k patologické expresi huntingtov choroby u eukaryot. Jak a kde v elongačním cyklu nastává 1FS, zůstává špatně pochopeno. Zde řešíme tuto výzvu pomocí cryoEM k vizualizaci 1FS na 1FS náchylných mRNA sekvencích. Prezentujeme kryoEM struktury komplexů 70S, umožňující vizualizaci elongace a translokace pomocí GTPázového elongačního faktoru G (EFG). Čtyři struktury s?1FS mRNA ukazují, že k posunu rámce dochází během translokace tRNA a mRNA. Pretranslokační komplex náchylný k 1FS udržuje párování antikodon kodon s nulovým rámcem, které se podobá tomu v kanonických elongačních komplexech. Ve středním translokačním komplexu s EFG se tRNA posouvá do 1 rámce blízko místa P, s vybouleným nukleotidem mezi kodony E a P místa stabilizovanými G926 na 16S rRNA. Ribozom zůstává ve stavu po translokaci posunutý. Naše zjištění odhalují, že ribozom je před translokací předurčen pro 1 FS a že posun rámce je proveden v mezistupni translokace katalyzované EFG. |
| Související projekty: |