SBILib: a handle for protein modeling and engineering

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

GOHL Patrick BONET Jaume FORNES Oriol PLANAS IGLESIAS Joan FERNANDEZ-FUENTES Narcis OLIVA Baldo

Rok publikování 2023
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Bioinformatics
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
www https://academic.oup.com/bioinformatics/article/39/10/btad613/7291855?login=true
Doi http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btad613
Klíčová slova protein modeling; protein engineering; tools
Přiložené soubory
Popis The SBILib Python library provides an integrated platform for the analysis of macromolecular structures and interactions. It combines simple 3D file parsing and workup methods with more advanced analytical tools. SBILib includes modules for macromolecular interactions, loops, super-secondary structures, and biological sequences, as well as wrappers for external tools with which to integrate their results and facilitate the comparative analysis of protein structures and their complexes. The library can handle macromolecular complexes formed by proteins and/or nucleic acid molecules (i.e. DNA and RNA). It is uniquely capable of parsing and calculating protein super-secondary structure and loop geometry. We have compiled a list of example scenarios which SBILib may be applied to and provided access to these within the library.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.