Multiple factors modulating the formation of toroidal membrane pores
| Název česky | Faktory modulující tvorbu toroidních membránových pórů |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2023 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Přiložené soubory | |
| Popis | Tvorba a stabilita pórů v buněčných membránách hraje klíčovou roli při doručování léčiv do buněk, jako jsou bakterie. Zejména stabilita toroidálních pórů - pórů s geometrií ve tvaru toroidu, kde lipidové hlavičky pokrývají okraj póru - je regulována především délkovým napětím spojeným s okrajem póru. Zatímco molekulární simulace jsou známým nástrojem pro hledání kandidátů na léčiva, simulace mohou také předpovídat potenciál nových terapeutik pro modulaci délkového napětí. Ne všechny modely (známé jako silová pole) určené pro počítačové simulace biologických systémů však správně zachycují délkové napětí lipidových membrán z savčích a bakteriálních buněk. Tento nedostatek pak brání přesnému návrhu léčiv. V této práci se zabýváme využitím molekulové dynamiky pro racionální návrh nových molekul, včetně antimikrobiálních peptidů, o nichž je známo, že vytvářejí póry a přemisťují se přes buněčné membrány. Nejprve se zabýváme faktory, jako je složení lipidů, které se liší mezi savčími a bakteriálními buňkami, a jedinečným prostředím roztoku, přičemž podrobněji popisujeme jejich vliv na délkové napětí. Dále popisujeme celý proces tvorby toroidních pórů, jeho molekulární detaily a představujeme metody k ohodnocení tvorby pórů pomocí počítačových simulací s využitím dostupných simulačních modelů. |
| Související projekty: |