Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u Staphylococcus aureus metodou PCR

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

HOBZA Roman DOŠKAŘ Jiří PANTŮČEK Roman

Rok publikování 2000
Druh Článek ve sborníku
Konference 4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Popis Kmeny Staphylococcus aureus rezistentní k meticilinu (MRSA) jsou častým zdrojem nozokomiálních infekcí představujících problém ve zdravotnických zařízeních. Pro léčbu má prvořadý význam rychlá a spolehlivá identifikace a charakterizace původce nákazy a jeho odlišení od nepatogenních kmenů. Bylo vybráno 11 kmenů MRSA v různých nemocnicích. Metodou PCR byla prokázána existence genu mecA, jež zodpovídá za rezistenci k meticilinu. Velikost amplifikačních produktů byla stejná u všech kmenů a po použití několika restrikčních endonukleáz nebyly zjištěny rozdíly v jejich nukleotidové sekvenci. Dále byly amplifikovány oblasti genu pro tvorbu koagulázy a regulační oblasti femA ovlivňující rezistenci k meticilinu. U amplifikačích produktů genu pro tvorbu koagulázy byl zjištěn polymorfismus délky restrikčních fragmentů, který však neumožňuje rozlišení všech kmenů. Restrikční analýza neprokázala odlišnosti v amplifikovaných sekvencích. Pro další analýzy, které by umožnily odlišit studované kmeny metodou PCR, byly použity primery, které amplifikují oblasti mezi geny pro 16S-23S rRNA. Tyto tzv. mezerníky jsou u S. aureus variabilní v počtu i velikosti. Výsledkem PCR byly pouze dva typy produktů, což koresponduje s hypotézou o monoklonálním původu MRSA. Pro potvrzení vhodnosti této metody k určování rozdílů v genomu bakterií bylo použito 13 kmenů S. aureus, reprezentujících 13 různých makrorestrikčních skupin. Amplifikace mezerníků prokázala odlišnosti mezi všemi kmeny. Na základě srovnání spekter PCR-produktů byl sestrojen dendrogram, znázorňující genetickou příbuznost kmenů, který byl porovnán s dendrogramem získaným z výsledků makrorestrikční analýzy DNA kmenů pomocí pulzní gelové elektroforézy. Mezi kmeny MRSA byl zjištěn kmen, jehož spektrum PCR-produktů se shoduje se spektrem produktů jednoho ze zástupců uvedených makrorestrikčních skupin.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.