Příprava specifických sond pro detekci profágů seroskupin A, B a F v lyzogenních kmenech Staphylococcus aureus

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

DOŠKAŘ Jiří PALLOVÁ Petra PANTŮČEK Roman ROSYPAL Stanislav RŮŽIČKOVÁ Vladislava PANTŮČKOVÁ Pavla KAILEROVÁ Jana KLEPÁRNÍK Karel MALÁ Zdena BOČEK Petr

Rok publikování 2000
Druh Článek ve sborníku
Konference 4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Popis Na základě kvantitativní HindIII-restrikční analýzy genomové DNA byla stanovena genetická příbuznost bakteriofágů S. aureus mezinárodní standardní řady. Fágy byly rozděleny do pěti klastrů označených A, F, Ba, Bb a Bc. Klastry A a F obsahují všechny fágy seroskupin A a F a odpovídají fágovým druhům 3A a 77 navrženým Ackermanem a DuBowen (1987). Fágy seroskupiny B byly rozděleny do tří samostatných klastrů (Ba, Bb a Bc), které se významně liší svými restrikčními spektry, což svědčí o jejich příslušnosti k více fágovým druhům. Pomocí hybridizační analýzy byly identifikovány společné HindIII-restrikční fragmenty specifické pro každou z fágových seroskupin A, B a F. Z restrikčních fragmentů fága 3A (1700 bp), fága 53 (4060 bp) a fága 77 (8300 bp) byly připraveny specifické sondy umožňující detekci profágů příslušných seroskupin v lyzogenních kmenech S. aureus. Vysoká účinnost sond byla prověřena u experimentálně připravených lyzogenních kmenů, u nichž se podařilo identifikovat až tři různé profágy. Pomocí odlišné barevné vizualizace sond lze přítomnost profágů jednotlivých seroskupin dokázat v daném lyzogenním kmeni v jediném hybridizačním experimentu. Byly sestrojeny restrikční mapy DNA fágů 3A, 53 a 77 reprezentující jednotlivé seroskupiny. Restrikční mapy fágů 3A a 77 jsou lineární, zatímco mapa fága 53 je kružnicová, s cirkulární permutací. DNA všech fágů seroskupin A a F mají kohezní konce. Velikost genomové DNA fágů mezinárodní řady stanovená pulzní gelovou elektroforézou se pohybuje v rozmezí 41.5 - 46.2 kb. Na restrikčních mapách byla stanovena místa odpovídající sekvencím sond. Příprava specifických sond značně usnadňuje stanovení přítomnosti profágů u klinických kmenů S. aureus a umožňuje využít tohoto důležitého znaku k jejich vzájemnému odlišení (typizaci).
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.