Genetická příbuznost kmenů <I>Enterococcus faecium</I> VanA u pacientů s hemato-onkologickým onemocněním
Autoři | |
---|---|
Rok publikování | 2003 |
Druh | Článek v odborném periodiku |
Časopis / Zdroj | Klinická mikrobiologie a infekční lékařství |
Fakulta / Pracoviště MU | |
Citace | |
www | http://kmil.trios.cz/obsah0603.htm |
Obor | Genetika a molekulární biologie |
Klíčová slova | Enterococcus faeciun; vancomycin resistance; molecular diagnostics |
Popis | Cíl: Cílem předložené práce byla molekulárně-biologická analýza kmenů Enterococcus faeciumVanA, izolovaných z klinického materiálu pacientů Hemato-onkologické kliniky Fakultní nemocnice Olomouc v období 1997-2002, z prostředí uvedené kliniky a formulace hypotézy o zdroji a šíření VRE. Materiál a metody: Z klinického materiálu pacientů byly standardními kultivačními metodami izolovány a identifikovány enterokoky, včetně stanovení citlivosti k antibiotikům. Molekulárně biologická analýza byla provedena u vankomycin-rezistentních kmenů E. faecium s fenotypem VanA. Ke stanovení příbuznosti kmenů byla použita makrorestrikční analýza celkové chromozomální DNA naštěpené restrikční endonukleázou SmaI. Výsledky: Celkem bylo ve sledovaném období izolováno 2 647 kmenů Enterococcus sp., přičemž 121 kmenů (4,6 %) bylo identifikováno jako VRE. Nejčastěji se jednalo o kmeny E. faeciumVanA (78 %) a E. faecalis VanB (10 %). Z prostředí uvedené kliniky, včetně biologického materiálu ošetřujícího personálu, bylo izolováno 5 vankomycin-rezistentních kmenů E. faeciumVanA. SmaI makrorestrikční spektrum genomové DNA analyzovaných kmenů Enterococcus faeciumVanA tvořilo více než 25 fragmentů o velikosti od 18 do 470 kb. U 60 kmenů bylo identifikováno 28 jedinečných restrikčních profilů, jejichž podobnost se pohybovala od 62 do 97 %. Mezi těmito profily byly dále identifikovány 4 často zastoupené klonální typy, obsahující 5 a více kmenů, s podobností DNA-profilu 90 % a vyšší. Diskuze a závěr: Na základě získaných výsledků lze předpokládat endogenní i exogenní původ izolovaných kmenů E. faeciumVanA. Lze potvrdit možnost přežívání těchto kmenů v prostředí nemocničního oddělení a následný přenos na hospitalizované pacienty. Současně je však nutné připustit i endogenní původ těchto kmenů a následnou selekci vlivem širokospektré antibiotické léčby. |
Související projekty: |