Proteome study on bacterium Paracoccus denitrificans and construction of 2-DE protein database
| Název česky | Proteomová analýza bakterie Paracoccus denitrificans a konstrukce 2-DE databáze bílkovin |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Biochemie |
| Klíčová slova | Paracoccus denitrificans; Proteome; Database |
| Popis | Celobuněčné lyzáty a membránové frakce bakterie Paracoccus denitrificans byly analyzovány pomocí dvourozměrné elektroforézy s imobilizovanými pH gradienty s cílem charakterizovat rozdíly v expresi proteinů během růstu za aerobních a několika typech anaerobních podmínek (s dusičnanem, dusitanem a oxidem dusným) a dále během růstu v přítomnosti respiračního inhibitoru azidu. Komparativní obrazová analýza 2-D gelů odhalila několik skupin z celkového počtu 800 proteinových skvrn, které byly charakteristicky indukovány anebo potlačeny v odpovědi na daný terminální akceptor elektronů. Také respirační inhibitor azid vykazoval významné ovlivnění proteinových profilů. Omezená informace o genomu studované bakterie neumožnila identifikovat více než 8 fyziologicky významných proteinů. V současné době se připravuje veřejné zpřístupění 2-DE databáze P.denitrificans. |
| Související projekty: |