Indel patterns of the plastid DNA trnL-trnF region within the genus Poa (Poaceae)

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Indelové paterny trnL-trnF regionu plastidové DNA v rámci rodu Poa (Poaceae)
Autoři	STONEBERG HOLT Sierra Dawn HOROVÁ Lucie BUREŠ Petr
Rok publikování	2004
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Journal of Plant Research
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
www	http://www.springerlink.com/index/10.1007/s10265-004-0172-4
Obor	Botanika
Klíčová slova	Indel patterns; infrageneric variability; Poa; Poaceae; trnL intron; trnL-trnF IGS
Popis	Pro klasifikaci skupin taxonů z rodu Poa s různými typy plastidových genomů byly použity indely (inzerce/delece) z trnL intronu a trnL-trnF mezigenového spaceru (IGS). V rámci 11 z 13 sekcí rodu Poa prezentovaných ve díle Flora Europaea bylo nově sekvencováno celkem 23 taxonů (P. alpina, P. badensis, P. bulbosa, P. crassipes, P. molinerii, P. annua, P. chaixii, P. granitica, P. pratensis, P. sibirica, P. remota, P. botryoides, P. cenisia, P. compressa, P. laxa, P. margilicola, P. media, P. nemoralis, P. palustris, P. pannonica, P. pirinica, P. riphaea, and P. sejuncta) a dále 18 sekvencí, dostupných z databáze NCBI. Sekvenční paterny indelů, zahrnující méně než 0.7 % plastidového genomu, potvrdily čtyři skupiny taxonů, již dříve vymezené na základě restrikční analýzy celé plastidové DNA. Zjištěné indely byly téměř vždy unikátní pro danou skupinu a nebylo je proto možné využít k posouzení vzájemné příbuznosti skupin. Byly však užitečné pro infragenerickou klasifikaci rodu Poa.
Související projekty:	Časoprostorová dynamika biodiverzity v ekosystémech střední Evropy