Characterization of esculin-positive Pseudomonas fluorescens strains isolated from an underground brook

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Charakteristika eskulinpozitivních kmenů Pseudomonas fluorescens izolovaných z podzemního potoka
Autoři

ŠVEC Pavel ŠTEGNEROVÁ Hana DURNOVÁ Eva SEDLÁČEK Ivo

Rok publikování 2004
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Folia Microbiologica
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Mikrobiologie, virologie
Klíčová slova Pseudomonas fluorescens; ribotyping; FAME; multiple enzyme restriction fragment length polymorphism; water; taxonomy
Popis Skupina 16 eskulinpozitivních fluorescentních pseudomonád izolovaných z podzemního potoka tekoucího jeskynním systémem byla charakterizována biotypizací, restrikční analýzou genu pro 16S rRNA (MERFLP), ribotypizací a analýzou mastných kyselin (FAME). Všechny kmeny byly fenotypově blízké druhu Pseudomonas fluorescens, ale vykázaly vysokou fenotypovou variabilitu a některé reakce atypické pro druh P. fluorescens. Protože biochemická identifikace pseudomonád je často nejednoznačná byly použity další techniky. Restrikční profil získaný metodou MERFLP jasně potvrdil, že všechny kmeny reprezentují druh P. fluorescens. Ribotypizace rozdělila analyzované kmeny do čtyř skupin, které odpovídaly biochemickým výsledkům. FAME analýza seskupila všechny analyzované kmeny do jedné skupiny spolu s referenčními kmeny P. putida (biotyp A, B), P. chlororaphis a P. fluorescens biotyp F, ale separovala je od dalších FAME profilů všech pseudomonád obsažených ve standardní knihovně TSBA 40 (MIDI).
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.