Protein Secondary Structure Prediction by Machine Learning Methods

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Rozpoznavani sekundarni struktury proteinu metodami strojoveho uceni
Autoři	HROZA Jiří
Rok publikování	2005
Druh	Článek ve sborníku
Konference	1st International Summer School on Computational Biology
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
Obor	Informatika
Klíčová slova	machine learning; protein; protein secondary structure prediction
Popis	Clanek se zabyva aplikaci metod strojoveho uceni na problem predikce sekundarni struktury neznamych proteinu. Cilem je porovnat umele neuronove site, jako nejmodernejsi pouzivane metody, s rozhodovacimi stromy a naivnim Bayesovskym klasifikatorem. Podrobne experimenty jsou provadeny na vybranych datech z PDB databaze proteinu. Vysledky ukazuji, ze rozhodovaci stromy dosahuji mnohem lepsich vysledku (87.4%) nez neuronove site (80.5%). Oproti tomu naivni Bayesuv klasifikator se ukazal jako neprilis vhodny.
Související projekty:	Interakce člověka s počítačem, dialogové systémy a asistivní technologie