The optimization of sample treatment for spectral karyotyping with applications for human tumour cells
| Název česky | Optimalizace zpracování preparátů pro spektrální karyotypování s využitím pro lidské nádorové buňky |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2007 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Cytogenetic and Genome Research |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | spectral karyotyping; molecular cytogenetics; aging procedure; protease pretreatment; human tumour cells; neuroblastoma; Wilms' tumour |
| Popis | Spektrální karyotypování (SKY) představuje důležitý metodický přístup v oblasti výzkumu komplexních chromosomálních přestaveb (CCRs) u mnoha typů lidských malignit, u nichž může být obtížná charakterizace pomocí konvenčních pruhovacích technik. Hlavním cílem naší práce byla optimalizace nejdůležitějších kroků při přípravě preparátů pro techniku SKY - tedy procedury zestaršení preparátů a předpůsobení pomocí proteáz - s ohledem na uchování struktury a tvaru chromosomů a na intenzitu hybridizačních signálů. Nejlepší výsledky byly dosaženy pomocí chemického zestaršení s využitím SSC nebo ethalonu v kombinaci s s krátkým předpůsobením trypsinem o vysoké koncentraci. Následně byl navržen výsledný optimalizovaný protokol pro SKY, který je využitelný i pro buňky lidských solidních nádorů. Praktický potenciál optimalizovaného protokolu pro SKY byl demonstrován na příkladu dvou druhů lidských embryonálních nádorů - neuroblastomu a Wilmsova tumoru, u nichž některé typy chromosomálních aberací nebyly detekovatelné pomocí klasických cytogenetických metod. |
| Související projekty: |