Testování kandidátních lokusů pro typizaci klinických izolátů Treponema pallidum.

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	MATĚJKOVÁ Petra FLASAROVÁ Magdalena ŠMAJS David WOZNICOVÁ Vladana
Rok publikování	2007
Druh	Článek ve sborníku
Konference	XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.
Fakulta / Pracoviště MU	Lékařská fakulta
Citace
Obor	Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova	Candidate loc; clinical testing; Treponema pallidum.
Popis	Bylo provedeno pilotní testování lokusů potenciálně využitelných k typování PCR pozitivních vzorků klinického materiálu syfilitických pacientů. Testované lokusy byly vybrány na základě mapování heterologních úseků mezi kmeny Nichols, SS14 (syfilitické kmeny) a Samoa D (kmen yaws) s využitím metody komparativní genomové sekvenace. Jednalo se o hypotetické geny TP0136 a TP0548 v genomu T. pallidum subsp. pallidum kmene Nichols. Bylo provedeno srovnání sekvencí těchto genů v klinickém materiálu s typovými kmeny T. pallidum poddruhů pallidum, pertenue a endemicum.
Související projekty:	Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum