Genetické rozdíly mezi původci yaws a syfilis.

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

STROUHAL Michal ŠMAJS David MATĚJKOVÁ Petra

Rok publikování 2007
Druh Článek ve sborníku
Konference XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků
Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova Genetic differences; yaws; syfilis
Popis Rod Treponema zahrnuje několik patogenních spirochet: T. pallidum ssp. pallidum (TPA) je původcem sexuálně přenosného onemocnění syfilis, T. pallidum ssp. pertenue (TPE) vyvolává endemické nevenerální treponemální infekce a T. paraluiscuniculi (TPAR) způsobuje venerickou spirochetózu králíků a není patogenní pro člověka. V této studii byly porovnány genomy blízce příbuzných treponemálních kmenů Nichols (TPA), SS14 (TPA), Samoa D (TPE) a Cuniculi A (TPAR) pomocí metody whole genome fingerprinting (WGF) a komparativního genomového sekvenování (CGS). U WGF byly genomy studovaných kmenů rozděleny do 97 překrývajících se intervalů, tyto intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Jednotlivé restrikční profily byly použity k identifikaci heterologních oblastí. CGS byla založená na hybridizaci testované genomové DNA kmenů SS14, Samoa D a Cuniculi A k referenční genomové DNA kmene Nichols na oligonukleotidovém čipu. Byly získány kompletní nukleotidové sekvence kmenů SS14 (TPA) a Samoa D (TPE). Sekvenční rozdíly mezi genomy blízce příbuzných treponem zjištěné metodami WGF a CGS byly použity pro definování poddruhové variability T. pallidum a vytipování kandidátních úseků pro screening klinických izolátů.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.