Genomová struktura spirochet rodu Treponema.

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

ŠMAJS David MATĚJKOVÁ Petra STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ZOBANÍKOVÁ Marie ŠMARDA Jan

Rok publikování 2007
Druh Článek ve sborníku
Konference 24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické.Abstrakty.
Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova Genome structure; Treponema; spirochete
Popis Byly získány genomové sekvence sedmi zástupců rodu Treponema, t.j. 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols, SS14, Dal-1), 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pertenue (CDC2, Gauthier, Samoa D) a Treponema paraluiscuniculi kmene Cuniculi A. Získané genomové sekvence byly porovnány a nalezené rozdíly byly korelovány s mírou patogenity a invazivity jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů. Sekvenční rozdíly mezi genomy stejného poddruhu sloužily pro definování rozsahu genetické variability uvnitř poddruhu a k identifikaci genetických rozdílů odpovědných za odlišnou míru patogenity jednotlivých kmenů. Mezipoddruhové rozdíly pak určovaly různou míru patogenity mezi poddruhy pallidum a pertenue. Mezidruhové rozdíly definovaly rozdíly mezi patogenními a nepatogenními spirochetami. Porovnáním genomů jsme identifikovali variabilní úseky genomů, které mohou sloužit pro molekulární identifikaci jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.