Genomová struktura spirochet rodu Treponema.
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2007 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | 24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické.Abstrakty. |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | Genome structure; Treponema; spirochete |
| Popis | Byly získány genomové sekvence sedmi zástupců rodu Treponema, t.j. 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols, SS14, Dal-1), 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pertenue (CDC2, Gauthier, Samoa D) a Treponema paraluiscuniculi kmene Cuniculi A. Získané genomové sekvence byly porovnány a nalezené rozdíly byly korelovány s mírou patogenity a invazivity jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů. Sekvenční rozdíly mezi genomy stejného poddruhu sloužily pro definování rozsahu genetické variability uvnitř poddruhu a k identifikaci genetických rozdílů odpovědných za odlišnou míru patogenity jednotlivých kmenů. Mezipoddruhové rozdíly pak určovaly různou míru patogenity mezi poddruhy pallidum a pertenue. Mezidruhové rozdíly definovaly rozdíly mezi patogenními a nepatogenními spirochetami. Porovnáním genomů jsme identifikovali variabilní úseky genomů, které mohou sloužit pro molekulární identifikaci jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů. |
| Související projekty: |
|