Visualization of Tunnels in Protein Molecules
| Název česky | Vizualizace tunelů v molekulách proteinů |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2007 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | Computer graphics, virtual reality, visualisation and interaction in Africa AFRIGRAPH '07 |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | http://portal.acm.org/citation.cfm?id=1294704&coll=Portal&dl=ACM&CFID=6986965&CFTOKEN=49167465 |
| Obor | Informatika |
| Klíčová slova | protein; tunnel; visualization; tetrahedrization; Loop subdivision |
| Popis | Tento článek prezentuje dva nové přístupy k vizualizaci tunelů v molekulách proteinů. Dlouhodobý výzkum v oblasti analýzy proteinů prokázal, že schopnost proteinů reagovat s jinou molekulou úzce souvisí s přítomností takzvaných tunelů. Tyto struktury hrají významou úlohu zejména při návrhu nových léčiv. Následným krokem je vizualizace těchto spočtených tunelů, která umožní biochemikovi určit ty části tunelu, které jsou podstatné při tvorbě léčiv. Předchozí vizualizační metody zobrazovaly tunel jako sekvenci protínajících se koulí. Naše nové přístupy využívají pro zobrazení Delaunayho tetrahedrizaci, která vzniká již při procesu hledání tunelů. Nově navržené algoritmy tedy zobrazují tunel jako povrch vygenerovaný ze sekvence tetrahedronů tvořících hranici spočteného tunelu. |
| Související projekty: |