CAVER 2.1

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

BENEŠ Petr KOZLÍKOVÁ Barbora STRNAD Ondřej ŠUSTR Vilém CHOVANCOVÁ Eva PAVELKA Antonín BREZOVSKÝ Jan SZABÓ Tibor ZAMBORSKÝ Matúš SOCHOR Jiří DAMBORSKÝ Jiří BIEDERMANNOVÁ Lada

Rok publikování 2010
Druh Software
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

www http://decibel.fi.muni.cz/caver/
Popis CAVER algoritmus umožňuje plně automatizovaný výpočet takzvaných tunelů v molekulách proteinů. Výpočet probíhá jak na statických datech, tak na sekvencích molekulové dynamiky, kdy dochází k automatické detekci daného tunelu v jednotlivých snímcích. CAVER je dostupný jako zásuvný modul pro program PyMOL nebo jako součást aplikace CAVER Viewer. Ta se věnujekromě jiného zejména vizualizaci spočtených tunelů a pomocí různých funkcí umožňuje následnou analýzu takovýchto tunelů. CAVER Viewer je možné získat jako samostatnou aplikaci nebo ve formě Java Web Start na stránkách projektu.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.