Efficiency of PCR-based methods in discriminating Bifidobacterium longum ssp. longum and Bifidobacterium longum ssp. infantis strains of human origin

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Účinnost metod založených na PCR při rozlišení kmenů Bifidobacterium longum ssp. longum a Bifidobacterium longum ssp. infantis lidského původu
Autoři

ŠRŮTKOVÁ Dagmar ŠPANOVÁ Alena ŠPANO Miroslav DRÁB Vladimír SCHWARZER Martin KOZÁKOVÁ Hana RITTICH Bohuslav

Rok publikování 2011
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Journal of Microbiological Methods
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.06.014
Obor Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova Bifidobacterium longum; PCR; ARDR; RAPD; rep-PCR
Popis K rozlišení B. longum ssp. longum and B. longum ssp. infantis byly použity 4 molekulárně-biologické metody (polymerázová řetězová reakce (PCR), metoda náhodně amplifikované polymorfní DNA (RAPD) s 5 primery, interrepetitivní polymerázová řetězová reakce (rep-PCR) s primery pro BOXA1R elementy a (GTG)5, restrikční analýza amplifikované ribosomální DNA (ARDRA) a biochemické metody. Bylo analyzováno 28 kmenů izolovaných z 25 zdravých a plně kojených dětí a 3 dospělých jedinců a 2 sbírkové kmeny. Uvedené metody společně s fermentací arabionosy/ melezitosy rozlišily B. longum ssp. longum a B. longum ssp. infantis do podruhů pouze sbírkové kmeny. Na druhé straně ARDRA zařadila do podruhů B. longum/infantis analyzované kmeny při použití jedinné restrikční endonukleasy Sau3AI. Dále byly zařazeny do podruhů sbírkové kmeny B. longum CCM 3764 jako B. longum ssp. longum CCM 3764, B. longum ATCC 17930 jako B. longum ssp. infantis ATCC 17930.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.