Kryogenická postseparační úprava polyakrylamidových gelů prometaloproteomické analýzy kombinací gelové elektroforézy, laserové ablace a hmotnostní spektrometrie s ionizací indukčně vázaným plazmatem
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2011 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Chemicke listy |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | paper summary |
| Obor | Analytická chemie, separace |
| Klíčová slova | gel electrophoresis;laser ablation;inductively coupled plasma;mass spectrometry;metalloprotein;metal binding protein;cryogenic ablation cell;cellophane foil;gel drying |
| Popis | Analýza kovových specií v kryogenicky zmrazených gelech pocházejících ze separace polyakrylamidovou gelovou elektroforézou provedená laserovou ablací spojenou s hmotnostní spektrometrií a indukčně vázaným plazmatem (GLIM) byla studována pro identifikaci a kvantifikaci separovaných metaloproteinů. Bylo provedeno srovnání s tradičními způsoby sušení gelů před ablací (běžné sušení, sušení gelu mezi dvěma celofánovými fóliemi), které jsou nezbytné před laserovou ablací, aby se zabránilo nežádoucím interferencím týkajícím se produkce plynu při laserové ablaci gelu z jeho kapalného obsahu. Laserová ablace gelů v kryogenní ablační cele (-80 st. C, 25 min) s obsahem BSA-Co 1:1 a ADH se Zn (II) je relevantní alternativou k tradičním způsobům, protože významně šetří čas (až desítky hodin namísto dnů), poskytuje srovnatelné s výsledky ve smyslu vysokých intenzit signálů a nízkých RSD v ICP-MS a umožňuje vícenásobné použití gelu po kryogenní ablaci, např. pro hmotnostní spektrometrií řízenou identifikaci aproteinu. |
| Související projekty: |