Metodologie stanovení variability alel MHC genů u ryb čeledi Cyprinidae

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	CIVÁŇOVÁ Kristína VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ Andrea HEJLOVÁ Kristýna MARTIN Jean-Francois
Rok publikování	2011
Druh	Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Popis	K analýze variability exprimovaných genů DAB1 a DAB3 u kaprovitých ryb jsme použili 2 metody. První metoda zahrnuje SSCP analýzu, klonování PCR amplikonů, a automatické sekvenování. Jako druhou jsme optimalizovali přípravu vzorků pro „klonální“ sekvenování druhé generace (NGS – next generation sequencing) s využitím technologie 454 pyrosekvenování. V příspěvku srovnáváme klady a zápory námi používaných metod testování.
Související projekty:	Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase Úloha imunitní investice v kontextu kompromisů: imunoekologické studium vztahů mezi reprodukcí, imunitou a parazitizmem u sladkovodních ryb Hostitelsko-parazitické interakce v hybridních systémech kaprovitých ryb