The variation of base composition in plant genomes

Logo poskytovatele
Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Diverzita bázového složení rostlinných genomů
Autoři

ŠMARDA Petr BUREŠ Petr

Rok publikování 2012
Druh Kapitola v knize
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Popis Vzájemný poměr čtyř nukleotidů se může výrazně lišit v různých částech genomové DNA stejně jako různými selekční faktory působící na jednotlivé sekvence. Základní složení DNA je obvykle vyjádřeno jako procento guaninu (G) a cytosinu (C), tj. obsah GC bází v daném regionu nebo v celém genomu (genomický GC obsah). Jak znalost mechanismů způsobujících změny v obsahu GC, tak jejich ekologické důsledky jsou zásadní pro pochopení evoluce genomu. Studie obsahu GC má dlouhou tradici v prokaryotické biologii a systematice, kde slouží jako důležité kritérium pro vymezení taxonů a charakteristiky životních stylů, jakými mohou být termotolerance, rychlost růstu nebo aerobita. GC obsah byl také široce diskutován v genomice zvířatech, a to v souvislosti se vznikem isochorové struktury genomu člověka a ostatních teplokrevných obratlovců. Nicméně, menší pozornost byla dosud věnována GC obsahu rostlinných genomů, u nichž je dosud poznání variability tohoto genomického parametru, stejně jako jeho význam v ekologii a evoluci jednotlivých taxonů dosud málo poznán. V našem přehledu se snažíme zmapovat stávající znalosti týkající se GC obsahu genomu rostlin a nastínit některé směry pro možný výklad o biologickém smyslu změny v obsahu GC v kontextu prací na bakteriálních genomů a zvířat. Doufáme, že nastíněnými příklady a návrhy vysvětlení bude stimulovat budoucí testování jejich platnosti v rostlinných genomech. I když jsme se v první řadě soustředili na celkové genomové základní složení, dynamika změn obsahu GC a jejich funkce v jednotlivých složkách genomu je diskutována.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.