Dynamic Structures of DNA Heptamers with Different Central Trinucleotide Sequences Studied by Electrochemical and Spectral Methods

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	PILAŘOVÁ Iveta KEJNOVSKÁ Iva VORLÍČKOVÁ Michaela TRNKOVÁ Libuše
Rok publikování	2014
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Electroanalysis
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
www	http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/elan.201400288
Doi	http://dx.doi.org/10.1002/elan.201400288
Obor	Fyzikální chemie a teoretická chemie
Klíčová slova	DNA heptamers; Voltammetry; Elimination voltammetric procedure; Circular dichroism; Polyacrylamide gel electrophoresis
Popis	A short, single-stranded DNA fragment d(GCGAAGC) and its analogs d(GCNNNGC) carrying different trinucleotide sequences in the center of the molecule (AAA,CCC, GGG or TTT) were investigated by spectral (CD and UV spectra) and electrochemical methods (voltammetry, polyacrylamide gel electrophoresis). Our results show that (i) the central triplet GAA or AAA dramatically stabilizes DNA hairpins, (ii) a stem-loop configuration is not supported by CCC or TTT sequences, instead, these heptamers adopt bimolecular duplex forms. Finally (iii), in the case of GGG sequence a very stable supramolecular G-quadruplex is formed.
Související projekty:	CEITEC - středoevropský technologický institut Chemická a elektrochemická analýza purinových derivátů Vývoj metod a instrumentace pro analýzu biologicky významných látek 2014