Eudiplozoon nipponicum (Monogenea): Challenge for next-generation sequencing

Logo poskytovatele
Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

DVOŘÁKOVÁ Hana JEDLIČKOVÁ Lucie KAŠNÝ Martin ILGOVÁ Jana BROŽ Pavel STRNAD Hynek LEONTOVIČ Roman ROUDNICKÝ Pavel VOREL Jiří DZIKA Ewa MIKEŠ Libor GELNAR Milan

Rok publikování 2015
Druh Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Popis Eudiplozoon nipponicum (family Diplozoidae, Polyopisthocotylea) is the hematophagous ectoparasite from the gills of cyprinid fish (Cyprinus carpio). The properties of genes (e.g. identity, structure, evolution) and proteins (e.g. function) of the members from the family Monogenea are among the less investigated in whole phylum Platyhelminthes. Up to now only two genomes and one transcriptome of monogenean species have been sequenced – genome of Protopolystoma xenopodis (Polyopisthocotylea) and Gyrodactylus salaris (Monopisthocotylea) and transcriptome of Neobenedenia melleni. Therefore we adopted the Illumina MiSeq/HiSeq techniques for sequencing the genomic DNA and RNA isolated from adult worms of E. nipponicum. This was followed by comprehensive bioinformatic analysis of sequential data.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.