eBCSgen: A Software Tool for Biochemical Space Language

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

TROJÁK Matej ŠAFRÁNEK David MERTOVÁ Lukrécia BRIM Luboš

Rok publikování 2020
Druh Článek ve sborníku
Konference 18th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, CMSB 2020
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
www https://doi.org/10.1007/978-3-030-60327-4_20
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-60327-4_20
Klíčová slova rule-based modelling; parameter synthesis; static analysis; Galaxy tool
Popis eBCSgen is a tool for development and analysis of models written in Biochemical Space Language (BCSL). BCSL is a rule-based language for biological systems designed to combine compact description with a specific level of abstraction which makes it accessible to users from life sciences. Currently, eBCSgen represents the only tool completely supporting BCSL. It has the form of a command line interface which is integrated into Galaxy – a web-based bioinformatics platform automating data-driven and model-based analysis pipelines
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.