Informace o projektu
Konstrukce syntetické metabolické dráhy pro degradaci důležitého environmentlního polutantu proteinovým a metabolickým inženýrstvím

Informace

Projekt nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

GAP503/12/0572

Období řešení

1/2012 - 12/2016

Investor / Programový rámec / typ projektu

Grantová agentura ČR

Standardní projekty

Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Cílem tohoto projektu je sestavit syntetickou biochemickou dráhu klonováním genů enzymů optimalizovaných proteinovýmm inženýrstvím, vedoucí ke konstrukci bakterie degradující environmentální polutant 1,2,3-trichlorpropan (TCP). Tato bakterie bude růst na TCP jako jediném zdroji uhlíku a energie.

Publikace

Počet publikací: 25

2014

Computational Tools for Designing and Engineering Enzymes.

DAMBORSKÝ Jiří BREZOVSKÝ Jan

Článek v odborném periodiku

Current Opinion in Chemical Biology, rok: 2014, ročník: 19, vydání: april
Computer-Assisted Engineering of Synthetic Pathway for Biodegradation of Toxic Persistent Pollutant.

KURUMBANG Nagendra Prasad DVOŘÁK Pavel BENDL Jaroslav BREZOVSKÝ Jan PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

Článek v odborném periodiku

ACS Synthetic Biology, rok: 2014, ročník: 3, vydání: 3, DOI
Dynamics and Hydration Explain Failed Functional Transformation in Dehalogenase Design.

SYKORA J. BREZOVSKÝ Jan KOUDELÁKOVÁ Táňa LAHODA M. FOŘTOVÁ Andrea CHERNOVETS T. CHALOUPKOVÁ Radka ŠTĚPÁNKOVÁ Veronika PROKOP Zbyněk KUTA SMATANOVA I. HOF M. DAMBORSKÝ Jiří

Článek v odborném periodiku

Nature Chemical Biology, rok: 2014, ročník: 10, vydání: 6
Fructose 1-Phosphate is the One and Only Physiological Effector of the Cra (FruR) regulator of Pseudomonas putida.

CHAVARRIA M. DURANTE-RODRIGUEZ G. KRELL T. SANTIAGO C. BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří DE LORENZO V.

Článek v odborném periodiku

FEBS Open Bio, rok: 2014, ročník: 4, vydání: 2014, DOI
Immobilized Synthetic Pathway for Biodegradation of Toxic Recalcitrant Pollutant 1,2,3-Trichloropropane.

DVOŘÁK Pavel BIDMANOVÁ Šárka DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

Článek v odborném periodiku

Environmental Science & Technology, rok: 2014, ročník: 48, vydání: 12, DOI
Maximizing the Efficiency of Multi-enzyme Process by Stoichiometry Optimization.

DVOŘÁK Pavel KURUMBANG Nagendra Prasad BENDL Jaroslav BREZOVSKÝ Jan PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

Článek v odborném periodiku

ChemBioChem, rok: 2014, ročník: 15, vydání: 13, DOI
Stepwise Enhancement of Catalytic Performance of Haloalkane Dehalogenase LinB towards Beta-Hexachlorocyclohexane.

MORIUCHI Ryota TANAKA Hiroki NIKAWADORI Yuki ISHITSUKA Mayuko ITO Michihiro OHTSUBO Yoshiyuki TSUDA Masataka DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk NAGATA Yuji

Článek v odborném periodiku

Applied Microbiology and Biotechnology Express, rok: 2014, ročník: 4, vydání: 72, DOI

2013

Expansion of Access Tunnels and Active-Site Cavities Influence Activity of Haloalkane Dehalogenases in Organic Cosolvents.

ŠTĚPÁNKOVÁ Veronika KHABIRI M. BREZOVSKÝ Jan PAVELKA Antonín SYKORA J. AMARO M. MINOFAR B. PROKOP Zbyněk HOF M. ETTRICH R. CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří

Článek v odborném periodiku

ChemBioChem, rok: 2013, ročník: 14, vydání: 7, DOI
Gates of Enzymes.

GORA Artur Wiktor BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří

Článek v odborném periodiku

Chemical Reviews, rok: 2013, ročník: 113, vydání: 8, DOI
Haloalkane dehalogenases: Biotechnological applications

KOUDELÁKOVÁ Táňa BIDMANOVÁ Šárka DVOŘÁK Pavel PAVELKA Antonín CHALOUPKOVÁ Radka PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

Článek v odborném periodiku

Biotechnology Journal, rok: 2013, ročník: 8, vydání: 1, DOI