Informace o projektu
Dynamika proteomu v odpovědi na zvýšené hladiny cytokininů u Arabidopsis
- Kód projektu
- IAA600040701
- Období řešení
- 1/2007 - 12/2010
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
- Klíčová slova
- cytokininy, proteom, fosforylace proteinů, Arabidopsis, systém genové exprese indukovatelný dexametazonem, 2-D elektroforéza proteinů, MALDI-TOF/TOF MS
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc.
- Odpovědná osoba Ing. Janette Bobálová, CSc.
Cytokininy (CK) se podílejí, v interakci s dalšími rostlinnými hormony, na regulaci řady vývojových procesů u rostlin. Přesné molekulární mechanizmy působení CK v regulaci vývoje rostlin jsou v současnosti předmětem intenzivního výzkumu. Zatímco analýza profilů exprese genomu v průběhu působení CK byla již započata jinými skupinami, zde navrhujeme analyzovat dynamiku proteomu v odpovědi na zvýšení hladin CK u Arabidopsis za podmínek podobných těm, které byly použity dříve při sledování změn v genové expresi na úrovni celého genomu. To nám umožní provést první srovnání údajů popisujících transkriptom a proteom u vysoce podobných vzorků. Zvýšení hladin CK bude dosaženo působením exogenních CK a využitím nového systému genové exprese indukovatelné dexametazonem - pOp/LhGR. Lze očekávat, že přímé srovnání účinků tří odlišných tříd CK přispěje k objasnění jejich individuálních funkcí v regulaci vývoje rostlin.
Publikace
Počet publikací: 18
2009
-
Early cytokinin response proteins and phosphoproteins of Arabidopsis thaliana identified by proteome and phosphoproteome profiling
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
Modulation of cytokinin action by decreased intensity of white light in Arabidopsis - a proteomic analysis
XXXIX Annual Meeting of the European Society for New Methods in Agricultural Research: Book of Abstracts, rok: 2009
-
Phosphopeptides analysis using enrichment techniques and matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
Phosphopeptides analysis using enrichment techniques and matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry
3rd Central and Eastern European Proteomics Conference. Book of Abstracts, rok: 2009
-
Proteomic analysis of A. thaliana influenced by light and cytokinins
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
Purification and characterization of proteins from plant material using divergent flow isoelectric focusing followed by MALDI MS
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
2008
-
A New Approach to Protein Enzymatic Digestion for Fast Protein Identification by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-Of-Flight Mass Spectrometry
Rok: 2008
-
Investigation of the matrix influence on the quality of MALDI-TOF mass spectra of intact proteins and glycoproteins
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty