Informace o projektu
Charakterizace MAGE proteinů: kofaktory E3 ubiquitin ligáz?

Informace

Projekt nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

IAA501630902

Období řešení

1/2009 - 12/2011

Investor / Programový rámec / typ projektu

Akademie věd ČR

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR

Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat.
Mgr. Sreenivas Reddy Bathula, Ph.D.
Mgr. Lucie Bozděchová, Ph.D.
Marc Guérineau, Ph.D., M.Sc.
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D.
doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.
prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D.
Mgr. Kateřina Zábrady, Ph.D.
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.

Spolupracující organizace

The University of Sussex

Odpovědná osoba Prof. Alan R. Lehmann

Lidské buňky jsou schopné exprimovat 35 různých MAGE (Melanoma antigen) proteinů. MAGEG1-Nse1 heterodimer je součástí Smc5-6 komplexu, který se účastní opravy poškozené DNA. Kromě Nse1, který obsahuje RING-finger E3 ubiquitin ligasovou doménu, existují další dva příklady MAGE-RING finger interakcí. Pokus o predikci struktury MAGE homologní domény (MHD) naznačil její částečnou podobnost s doménou molekuly cullinu, který tvoří E3 ubiquitin ligasový komplex. V tomto projektu chceme ověřit hypotézu: "MAGE proteiny slouží jako kofaktory E3 RING ubiquitin ligás." Budeme mutovat konzervované aminokyselinové zbytky MAGEG1 proteinu tak, abychom zjistili, které z nich se podílí na interakci s Nse1. U specifických mutant budeme sledovat schopnost komplexu Smc5-6 učastnit se opravy DNA. Najdeme další RING finger proteiny a podrobíme je podobné analýze s cílem charakterizovat obecné interakční vlastnosti MAGE proteinů. Strukturu MHD budeme studovat pomocí NMR spektroskopie a difrakce krystalů.

Publikace

Počet publikací: 11

2015

The melanoma-associated antigen 1 (MAGEA1) protein stimulates the E3 ubiquitin-ligase activity of TRIM31 within a TRIM31-MAGEA1-NSE4 complex

KOZÁKOVÁ Lucie VONDROVÁ Lucie STEJSKAL Karel CHARALABOUS Panagoula KOLESÁR Peter LEHMANN Alan R. ULDRIJAN Stjepan SANDERSON Christopher M. ZDRÁHAL Zbyněk PALEČEK Jan

Článek v odborném periodiku

Cell Cycle, rok: 2015, ročník: 14, vydání: 6, DOI

2013

Evolution and function of non-SMC subunits of SMC5/6 complex

KOZÁKOVÁ Lucie BEDNÁŘOVÁ Kateřina HUDSON Jessica GUÉRINEAU Marc LEHMANN Alan PALEČEK Jan

Konferenční abstrakty

Rok: 2013, druh: Konferenční abstrakty

2012

Analysis of the Nse3/MAGE-binding Domain of the Nse4/EID Family Proteins

GUÉRINEAU Marc KŘÍŽ Zdeněk KOZÁKOVÁ Lucie BEDNÁŘOVÁ Kateřina JANOŠ Pavel PALEČEK Jan

Článek v odborném periodiku

PLoS One, rok: 2012, ročník: 7, vydání: 4, DOI
MAGE proteiny jako kofaktory buněčných procesů

KOZÁKOVÁ Lucie HUDSON Jessica BEDNÁŘOVÁ Kateřina GUÉRINEAU Marc PALEČEK Jan

Článek ve sborníku

XII. mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků z Čech a SLovenska, rok: 2012

2011

CHARACTERIZATION OF THE NSE4/EID BINDING TO NSE3/MAGE PROTEINS

GUÉRINEAU Marc KŘÍŽ Zdeněk KOZÁKOVÁ Lucie BEDNÁŘOVÁ Kateřina BATHULA Sreenivas Reddy HUDSON Jessica LEHMANN R. Alan PALEČEK Jan

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
Interactions between the Nse3 and Nse4 Components of the SMC5-6 Complex Identify Evolutionarily Conserved Interactions between MAGE and EID Families

HUDSON J J R BEDNÁŘOVÁ Kateřina KOZÁKOVÁ Lucie LIAO Chunyan GUÉRINEAU Marc COLNAGHI Rita VIDOT Susanne MAREK Jaromír BATHULA Sreenivas Reddy LEHMANN Alan PALEČEK Jan

Článek v odborném periodiku

PloS ONE, rok: 2011, ročník: 6, vydání: 2, DOI

2010

The MAGE and EID proteins affect transcription regulation of target genes

KOZÁKOVÁ Lucie BEDNÁŘOVÁ Kateřina HUDSON Jessica GUÉRINEAU Marc LIAO Chunyan COLNAGHI Rita MAREK Jaromír VIDOT Susanne LEHMANN Alan PALEČEK Jan

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
The Nse3/MAGE and Nse4/EID proteins are involved in transcription regulation

PALEČEK Jan BEDNÁŘOVÁ Kateřina HUDSON Jessica KOZÁKOVÁ Lucie GUÉRINEAU Marc LIAO Chunyan COLNAGHI Rita MAREK Jaromír VIDOT Susanne LEHMANN Alan

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
The NSE3/MAGE interactions with NSE4/EID proteins are evolutionarily conserved

BEDNÁŘOVÁ Kateřina KOZÁKOVÁ Lucie HUDSON Jessica GUÉRINEAU Marc KOZÁKOVÁ Lucie MAREK Jaromír GUÉRINEAU Marc LEHMAN Alan R. MAREK Jaromír PALEČEK Jan LEHMANN Alan R. PALEČEK Jan

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty

2009

Architecture and activities of Structure Maintenance of Chromosome SMC5/6 complex

PALEČEK Jan

Vyžádané přednášky

Rok: 2009, druh: Vyžádané přednášky