Project information
Molecular basis of Staufen-mediated 3´UTR function
- Project Identification
- GA18-08153S
- Project Period
- 1/2018 - 6/2021
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Při srovnání genetické informace červa a člověka, nekódující část genomu obrovsky vzrostla, zatímco počet protein kódujících genů zůstal konstantní. Tento nárůst se týká i 3´UTR mRNA o průměrné délce 1,2 kb, plnící funkci při mRNA transportu, kontrole translace a rozpadu mRNA. Navzdory důležitosti 3´UTR pro prostorovou a časovou kontrolu genové exprese, molekulární podstata funkce 3´UTR je z velké části neprobádána. Budeme pracovat na určování struktury komplexů 3´UTR signálů se Staufen1 proteinem a ribozomem, jež regulují mRNA stabilitu. Pomocí několika vzájemně se doplňujících strukturně-biologických přístupů budeme objasňovat molekulárně biologickou podstatu Staufen proteinem zprostředkované funkce 3´UTR pro posttranskripční regulaci genové exprese a poskytneme tak nová vysvětlení, jak tato deregulace přispívá ke vzniku běžných nemocí jako rakovina nebo neurodegenerativní onemocnění.
Publications
Total number of publications: 3
2020
-
Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition
Nucleic acids research, year: 2020, volume: 48, edition: 4, DOI
2019
-
Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition
Year: 2019, type: Conference abstract
2018
-
Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 SBS for specific target recognition
Year: 2018, type: Conference abstract