Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue.
| Authors | |
|---|---|
| Year of publication | 2010 |
| Type | Conference abstract |
| MU Faculty or unit | |
| Citation | |
| Description | Tropické kožní onemocnění yaws a sexuálně i kongenitálně přenosné onemocnění syfilis jsou přes odlišné klinické projevy způsobeny stejným bakteriálním druhem Treponema pallidum. Původcem yaws je poddruh pertenue (TPE) a původcem syfilis je poddruh pallidum (TPA). Poddruhy nelze morfologicky, sérologicky ani imunologicky odlišit. Byly sekvencovány 3 genomy TPE (kmeny Samoa D, CDC-2 a Gauthier). Navržené geny kmenů TPE byly porovnány s geny 3 kmenů TPA (Nichols, SS14 a DAL-1). Mezi TPE a TPA bylo nalezeno více než 1200 změn v DNA (jednonukleotidové substituce a indely a vícenukleotidové indely). Změny v DNA se projevily více než 570 aminokyselinovými změnami ve 286 proteinech anotovaných u TPE i TPA. Z toho pouze 92 genů (9 % ze všech anotovaných genů) kódovalo proteiny obsahující 2 a více aminokyselinových změn nebo posun čtecího rámce. Porovnáním celogenomových sekvencí TPA a TPE kmenů byly vytipovány geny, jež se mohou podílet na rozdílných klinických projevech syfilis a yaws, jejich funkce však zatím zůstává převážně neznámá. |
| Related projects: |