Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Analysis and Visualization of Protein Structures

Information

This project doesn't include Faculty of Arts. It includes Faculty of Informatics. Official project website can be found on muni.cz.
Investor logo
Project Identification
GAP202/10/1435
Project Period
1/2010 - 12/2012
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
  • Standard Projects
MU Faculty or unit
Faculty of Informatics
Keywords
visualization; virtual reality; protein, molecular dynamics
Cooperating Organization
University of West Bohemia in Pilsen
  • Responsible person doc. Ing. Ivana Kolingerová, Dr.

V projektu budou vyvíjeny a testovány nové analytické metody pro bioechemický výzkum proteinů. U dynamických modelů proteinů budou zkoumány jejich geometrické vlastnosti s cílem nalezení a posouzení tunelů, které propojují aktivní místo uvnitř proteinu s jeho povrchem. Vlastnosti tunelů, jako je povrch, objem, délka apod. budou statisticky hodnoceny pro rozsáhlé soubory snímků získaných ze simulace dynamiky proteinů. Výsledky budou vizualizovány názorným způsobem, poskytujícím nové informace biochemikům. Metody se také zaměří na interakci malých molekul (ligantů) procházejících nadějným tunelem, v čase i prostoru. Metody budou začleněny do do nástroje CAVER (vyvinutého na MU), který je v současné době využíván biochemiky po celém světě. Projekt je pokračováním projektu GA201/07/0927 Vizualizace proteinových struktur, podporovaného v období 2007-2009.

Publications

Total number of publications: 25

2012

2011

Previous 1 2 3 Next

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.