Directed evolution of lectins from pathogenic bacteria

Logo poskytovatele
Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Filozofickou fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Řízená evoluce lektinů z patogenních bakterií
Autoři

MRÁZKOVÁ Jana SAFY Marek POKORNÁ Martina WIMMEROVÁ Michaela

Rok publikování 2011
Druh Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Citace
Popis Řízená evoluce je široce využívána v proteinovém inženýrství pro tvorbu proteinů s pozměněnými, anebo vylepšenými vlastnostmi. Tento účinný nástroj zahrnuje několik hlavních přístupů. První je náhodná mutageneze, která je využívána pro tvorbu náhodných mutací kdekoliv ve vybraném genu. Druhý je cíleně-náhodná mutageneze, která se používá při přípravě mutantů s náhodnými změnami v konkrétním místě. Místně-cílená mutageneze je založena na racionálním designu a slouží ke tvorbě specifických substitucí na konkrétním místě. V naší práci se zaměřujeme na dva přístupy: cíleně-náhodnou mutagenezi pomocí směsi oligonucleotidových primerů a místně-cílenou mutagenezi pomocí dvou primerů nesoucích specifickou substituci. Lektiny jsou proteiny produkované různými organismy. Jsou schopny specificky vázat různé sacharidy. Tento fakt je velice důležitý zejména v interakci patogenu a hostitele, kde lektiny pomáhají patogenu při adhezi k cukerným zbytkům přítomných na hostitelské buňce. Pseudomonas aeruginosa, Ralstonia solanacearum a Burkholderia cenocepacia jsou příležitostné patogeny, které napadají zejména pacienty s oslabenou obranyschopností. Tyto bakterie produkují lektiny, které vykazují značnou podobnost. Lektin PA-IIL z bakterie P. aeruginosa byl zvolen jako primární cílový gen k modifikaci za pomocí místně-cílené mutageneze. Tento rozpustný protein je dobře charakterizován a vykazuje velmi vysokou afinitu k L-fucose, nicméně je schopen vázat několik monosacharidů s podobnou stereochemií jako například L-galaktosu, nebo D-manosu. Ortology tohoto lektinu byly identifikovány také v bakteriích R. solanacearum (RS-IIL) a B. cenocepacia (BC2L-A). Nicméně, tyto dva lektiny podobné PA-IIL preferují D-manosu namísto L- fucosy. Cílem této práce je příprava Ca-dependentních lektinů s přesnou specifitou k L-fucose. Lektin s vylepšenými vlastnostmi by mohl být dále využíván v biotechnologii a pro bioanalytické účely.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.