Informace o projektu
Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
- Kód projektu
- MSM 143300002
- Období řešení
- 1/1999 - 12/2004
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- image analysis; image processing; segmentation; preprocessing; deconvolution; 3D analysis; 3D reconstruction; mathematical morphology; parallel computing; parallel algorithms; optical microscopy; confocal microscopy; automation; automated microscopy
Cíl: Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi. Návrh předpokládá jak pokračování v běžícím výzkumu struktury buněčného jádra s klinickým uplatněním při diagnostice a prevenci leukémií a jiných nádorových onemocnění, tak rozšíření výzkumu na jiné aplikace počítačové analýzy mikroskopického obrazu, biomedicínské i průmyslové. Obsah: Zkoumány budou zejména algoritmy předzpracování a segmentace obrazu s důrazem na dekonvoluci 3D obrazu, na operace matematické morfologie a na 3D rekonstrukci obrazu ze série 2D obrazových řezů. Intenzivní výzkum bude veden také v oblasti paralelních algoritmů analýzy obrazu a paralelizace vybraných algoritmů na víceprocesorových pracovních stanicích s využitím vybavení Superpočítačového centra MU.Vzhledem ke značné interdisciplinárnosti,bude udržována těsná spolupráce s kolegy ze špičkových pracovišť v Oxfordu,Heidelbergu a dalších míst.
Výsledky
Cílem projektu je výzkum v oblasti počítačové analýzy mikroskopického obrazu, v oblasti automatizace procesu snímání a on-line analýzy obrazu a aplikace získaných poznatků v praxi.
Publikace
Počet publikací: 88
1999
-
Chromatin structure and its cell cycle kinetics in intact and irradiated cell nuclei
Fundamentals for the assesment of risks from environmental radiation, rok: 1999
-
Chromosomes participating in translocations typical of malignant hemoblastoses are also involved in exchange aberrations induced by fast neutrons
Radiation Research, rok: 1999, ročník: 151, vydání: 4
-
The position of centromeres in interphase nuclei of human leukemic cells during myeloid differentiation and after gamma-irradiation
Fluorescence microscopy and fluorescent probes, rok: 1999
-
The topological organization of chromosomes 9 and 22 in cell nuclei has a determinative role in the induction of t(9,22) translocations and in the pathogenesis of t(9,22) leukemias
Chromosoma, rok: 1999, ročník: 108, vydání: 7
-
Topography of some genes and chromosomes in interphase nuclei of human cells
Fluorescence microscopy and fluorescent probes, rok: 1999
1994
-
A bisection method to find all solutions of system of nonlinear equations.
Domain Decomposition Methods in Scientific and Engineering Computing, rok: 1994, počet stran: 1 s.
-
Complexes between osmium tetraoxide bispyridine and DNA: a molecular mechanics study
J. Biomol. Struct. Dynamics 12, rok: 1994, ročník: 1994, vydání: 12
1993
-
Decomposition of arithmetical NP-hard problems.
Inter. J. Computer Math. 48, rok: 1993, ročník: 1993, vydání: 48